Geneaqua –Genetic Technology for Aquaculture

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Type: MicroSME / SME

Acronym: GENEAQUA

Coordinator name: Adrián Millán Pérez

Name of the institution to which it belongs:

Address: Rúa Cantigas e Frores Nº 6, Entresuelo B, 27002, Lugo, España

Telephone: +34 982 818 858

E-mail: Send email

Web: https://www.geneaqua.com/

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Description:
Geneaqua –“Genetic Technology for Aquaculture”, es una empresa de base tecnológica (EBT) , spin off de la Universidad de Santiago de Compostela, ligada al grupo de investigación de la Facultad de Veterinaria Acuigen -“Genética para la acuicultura y la conservación de recursos biológicos”.Geneaqua es una empresa de base tecnológica que centra su actividad en proveer servicios de genética a las empresas acuícolas, para facilitar una mejora de su producción de manera rentable y sostenible, basándose en la aplicación de tecnología genética molecular. Ayudamos a las empresas acuícolas a seleccionar entre sus reproductores los que posean las mejores características de tasa de crecimiento, conversión del alimento o resistencia a enfermedades, según los intereses de la empresa. Las aportaciones de la genética para la mejora de la producción en acuicultura son diversas, pero nuestra empresa las enfoca principalmente en la utilización de herramientas moleculares para la trazabilidad familiar, la incorporación de información genómica para el diseño de planes de selección asistida por marcadores identificando los cruzamientos ideales a realizar para evitar consanguinidad y mejorar la producción.
Disponemos de la metodología que permite identificar mediante marcadores moleculares las características genéticas idóneas para la selección de reproductores, además de determinar su diversidad genética, establecer su genealogía y determinar paternidades. Nuestra tecnología genética y genómica es de carácter transversal, por lo puede aplicarse a cualquier especie de interés agronómico y, en particular, de la acuicultura.
Los principales servicios de nuestra empresa son el desarrollo de planes de selección familiar y mejora, utilizando herramientas genéticas y genómicas que permitan conocer la diversidad y las relaciones de parentesco entre todos los individuos del stock, ya que los planes de selección familiar se basan en la explotación de la diversidad genética existente dentro y entre familias para obtener la mayor ganancia por generación.

Areas of expertise: Biotechnology applied to aquaculture, Genetics and genomics applied to aquaculture

Keywords: Genética, genómica, acuicultura, mejora productiva, marcadores moleculares.

Number of researchers: 2

Number of doctors: 2

Scopus identifier:

Open Access Scientific Repository:

Projects

AQUA-FAANG. Advancing European Aquaculture by Genome Functional Annotation

Acronym: AQUA-FAANG

Financing program: H2020

Financing entity: UNIÓN EUROPEA

Start year: 2019

Ending year: 2023

Principal investigator: Coordinador-Sigbjørn Lien; IP Geneaqua- Adrián Millán Pérez

Project url: https://www.aqua-faang.eu/

FISHBOOST. The next level of aquaculture breeding

Acronym: FISHBOOST

Financing program: EUROPEO- 7 PROGRAMA MARCO

Financing entity: UNIÓN EUROPEA

Start year: 2014

Ending year: 2019

Principal investigator: Coordinador-Anna Kristina Sonesson; IP Geneaqua- Adrián Millán Pérez

Project url: http://www.fishboost.eu/

Programa de selección genética para la mejora de crecimiento en dorada (Sparus aurata, L.); evaluación del progreso genético alcanzado y nuevos criterios de selección

Acronym: BIOTECLEN

Financing program: CDTI

Financing entity: CDTI-AQUICULTURA BALEAR S.A.U. (ABSA S.A.U.)

Start year: 2017

Ending year: 2020

Principal investigator: IP Geneaqua- Adrián Millán Pérez

Project url:

Avances biotecnológicos en la reproducción, genética y sanidad del lenguado” (BIOTECLEN)

Acronym:

Financing program: CDTI

Financing entity: CDTI-Stolt Sea Farm S.A.

Start year: 2015

Ending year: 2018

Principal investigator: IP Geneaqua- Adrián Millán Pérez

Project url:

Programa de selección genética para la mejora de crecimiento en dorada (Sparus aurata, L.); evaluación del progreso genético alcanzado

Acronym:

Financing program: CDTI

Financing entity: CDTI-AQUICULTURA BALEAR S.A.U. (ABSA S.A.U.)

Start year: 2014

Ending year: 2017

Principal investigator: IP Geneaqua- Adrián Millán Pérez

Project url:

Publications

Reproductive performance of captive Senegalese sole, Solea senegalensis, according to the origin (wild or cultured) and gender.

Authors: Martín I., Carazo I., Rasines I., Rodríguez C., Fernández R., Martínez P., Norambuena F., Chereguini O. & Duncan N

Year of publication: 2019

Journal: Spanish Journal of Agricultural Research

DOI: http://doi.org/10.5424/sjar/2019174-14953

Disentangling genetic variation for resistance and endurance to scuticociliatosis in turbot using pedigree and genomic information.

Authors: Saura M., Carabaño M.J., Fernández A., Cabaleiro S., Doeschl-Wilson A.B., Anacleto O., Maroso F., Millán A., Hermida M., Fernández C., Martínez P. & Villanueva B

Year of publication: 2019

Journal: Frontiers in Genetics

DOI: http://doi.org/10.3389/fgene.2019.00539

Genetic structure and evidence of anthropogenic effects on wild population of two Neotropical catfishes: baselines for conservation

Authors: Prado F.D., Fernández-Cebrián R., Foresti F., Oliveira C., Martínez P. & Porto-Foresti F

Year of publication: 2018

Journal: Journal of Fish Biology

DOI: http://doi.org/10.1111/jfb.13486

Highly dense linkage maps from 31 full-sibling families of turbot (Scophthalmus maximus) provide insights into recombination patterns and chromosome rearrangements throughout a newly refined genome assembly

Authors: Maroso F., Hermida M., Millán A., Blanco A., Saura M., Fernández A., Dalla Rovere M., Bargelloni L., Cabaleiro S., Villanueva B., Bouza C. & Martínez P

Year of publication: 2018

Journal: DNA Research

DOI: http://doi.org/10.1093/dnares/dsy015

Hybridization and genetic introgression patterns between two South American catfish along their sympatric distribution range

Authors: Prado F.D., Fernández-Cebrián R., Hashimoto D.T., Senhorini J.A., Foresti F., Martínez P. & Porto-Foresti F

Year of publication: 2017

Journal: Hydrobiologia

DOI: http://doi.org/doi.org/10.1007/s10750-016-3010-5

Evolution and conservation of Characidium sex chromosomes

Authors: Utsunomia R., Scacchetti P.C., Hermida M., Fernández-Cebrián R., Taboada X., Fernández C., Bekaert M., Mendes N.J., Robledo D., Mank J.E., Taggart J., Oliveira C., Foresti F. & Martínez P

Year of publication: 2017

Journal: Heredity

DOI: http://doi.org/doi.org/10.1038/hdy.2017.43

Heritability estimation for okadaic acid algal toxin accumulation, mantle color and growth traits in Mediterranean mussel (Mytilus galloprovincialis)

Authors: Pino-Querido A., Alvarez-Castro J.M., Guerra-Varela J., Toro M.A., Vera M., Pardo B.G., Fuentes J., Blanco J. & Martínez P

Year of publication: 2015

Journal: Aquaculture

DOI: http://doi.org/doi.org/10.1038/hdy.2017.43

Infraestructure

Geneaqua se dedica al análisis de datos y asesoría genética, su valor más importante es el conocimiento. Cuenta con los equipos informáticos y las herramientas de análisis específicas adecuadas.

Services

DESARROLLO DE PLANES DE SELECCIÓN FAMILIAR: TRAZABILIDAD GENEALÓGICA

Service description:
La genética aporta la tecnología más potente para la mejora de la producción animal. Los planes de selección familiar se basan en la explotación de la diversidad genética existente dentro y entre familias para obtener la mayor ganancia por generación. Para ello, se diseñan los cruzamientos entre los reproductores de cada generación de selección atendiendo a su valor mejorante y evitando siempre los efectos perniciosos de los cruzamientos consanguíneos. Para todo ello es imprescindible el conocimiento del parentesco entre los individuos del stock. Teniendo en cuenta la mezcla usual de diferentes familias en un mismo tanque antes de la selección en la piscicultura, se hace imprescindible el desarrollo de herramientas moleculares que permitan establecer la genealogía para el buen desarrollo del programa de selección.

Type of service: Consultancy

Service URL: https://www.geneaqua.com/servicios

SEGUIMIENTO Y MEJORA DE LOS PLANES DE SELECCIÓN

Service description:
Aún en los casos en que las familias crecen en tanques individuales hasta que es posible marcar y seleccionar los mejores individuos, el uso de las herramientas de trazabilidad molecular es necesario para el chequeo de los cruzamientos y progenies diseñadas en el plan. La gran cantidad de tareas y manejo que implican los planes de selección hace necesario comprobar la existencia de errores en el manejo para su corrección y mejora de las prestaciones del programa de selección.

Type of service: Consultancy

Service URL: https://www.geneaqua.com/servicios

DESARROLLO DE PLANES DE MEJORA GENÉTICA

Service description:
Los principales caracteres diana de los planes de mejora genética en piscicultura están relacionados con el crecimiento, la reproducción, las patologías y las anomalías morfológicas. El conocimiento de la base genética de estos caracteres posibilita una selección más eficiente que la basada exclusivamente en el parentesco y fenotipo de los individuos. La genómica ha supuesto un avance revolucionario en este conocimiento y pone a disposición de los mejoradores marcadores genéticos asociados a mayor crecimiento, resistencia a patologías, sexo, etc. La selección asistida por marcadores consiste en la selección de reproductores que tengan en su ADN las variantes genéticas de interés comercial y permite una mayor eficiencia en el proceso de selección.

Type of service: Consultancy

Service URL: https://www.geneaqua.com/servicios

DESARROLLO DE MARCADORES MOLECULARES PARA ESTUDIOS POBLACIONALES O DE PARENTESCO

Service description:
A) Desarrollo de marcadores microsatélite: partir de una carrera en el secuenciador MiSeq de Illumina se obtendrán alrededor de 30 millones de secuencias de longitud promedio de 500 pb, que servirán para el rastreo de motivos microsatélite, diseño de primers y validación de polimorfismo en geles de agarosa y secuenciador automático (ABI 3730). Este servicio puede incluir todas las etapas o proporcionar únicamente el análisis bioinformático con los cientos de secuencias con marcadores microsatélite obtenidas tras la secuenciación. El usuario deberá aportar únicamente 10 ug de ADN de calidad para la carrera de secuenciación. B) Desarrollo de SNPs utilizando la tecnología RAD en un secuenciador NextSeq 500 de Illumina. Las secuencias obtenidas se ensamblarán mediante el uso de programas bioinformáticos, y se desarrollará una base de datos para localización de SNPs. El servicio incluye también la posibilidad de la puesta a punto y validación de SNPs y su combinación en multiplexes.

Type of service: Consultancy

Service URL: https://www.geneaqua.com/servicios

ESTUDIOS DE METAGENÓMICA

Service description:
A partir de las muestras biológicas que envíen los grupos interesados se realizará la amplificación de un fragmento altamente conservado del genoma de las especies diana y posterior secuenciación en el secuenciador MiSeq de Illumina. El ensamblaje de los amplicones tomando como referencia los genes de las especies de interés permitirá la identificación y cuantificación de la mezcla de especies existentes en la muestra.

Type of service: Consultancy

Service URL: https://www.geneaqua.com/servicios

SECUENCIACIÓN DE AMPLICONES DE INTERÉS Y GENOMAS BACTERIANOS

Service description:
Secuenciación de amplicones de genes de interés o de grupos de genes: A partir de los amplificados que envíen los grupos interesados se realizará una secuenciación en el secuenciador MiSeq y el posterior ensamblaje de los amplicones tomando como referencia los genes de la especie de interés. Secuenciación de genomas bacterianos: A partir del ADN genómico de la especie de interés se realizará una secuenciación en el MiSeq y su posterior ensamblaje tomando como referencia el genoma de la especie de interés. La secuenciación “de novo” también se podrá realizar. En este caso el ensamblaje requerirá un mayor trabajo bioinformático y consecuentemente un coste superior.

Type of service: Consultancy

Service URL: https://www.geneaqua.com/servicios