Genómica e Proteómica

Genómica é o estudo dos genomas dos organismos. O seu principal objetivo é determinar a sequência parcial ou completa do DNA por meio de uma amplificação de um único gene através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) ou através de sequenciação de genes em larga escala pelo Sequenciação de Nova Geração (NGS). Como o produto final de um gene geralmente é uma proteína, o conhecimento da sequência de DNA se tornou de vital importância na medicina e na biotecnologia, revelando as bases de algumas doenças por meio de mutações específicas. Além disso, a genómica evolutiva que combina trabalho experimental e ferramentas bioinformáticas é atualmente uma parte importante da investigação biológica no campo da genómica, permitindo a reconstrução filogenética das famílias de genes, com informações sobre a história natural da vida. A proteómica, juntamente com a genómica, é hoje em dia uma ferramenta de investigação indispensável nas ciências biológicas e ambientais. A evolução da tecnologia, nomeadamente ao nível da espectrometria de massa, permite hoje em dia o acesso a informações quantitativas de centenas de proteínas, que tem sido utilizado para interpretar respostas metabólicas e fisiológicas relevantes em organismos, que os métodos bioquímicos convencionais não podem fornecer. O CIIMAR utiliza várias estratégias proteómicas no campo da toxicologia, nomeadamente para entender e caracterizar o modo de ação de contaminantes ambientais em organismos aquáticos. Além disso, a proteómica tem sido usada para identificar e caracterizar propriedades metabólicas e fisiológicas únicas dos invertebrados marinhos. Concretamente, o CIIMAR possui experiência e fornece à comunidade científica as seguintes análises proteómicas: SDS-PAGE; -DE; Blue-native PAGE; label-free quantitative proteomics; shotgun proteomics. Até a presente data, o aumento contínuo de sequências de organismos não-modelo em bancos de dados públicos (genomas, transcriptomas e proteomas inteiros) impulsionou estudos proteogenômicos detalhados, descrevendo milhares de novos genes e proteínas, com insights sobre processos complexos em diversas vias metabólicas.