Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental

Tipo: Organizações públicas/privadas de investigação (OPI)

Acrónimo: CIIMAR

Nome do Coordenador: Vitor Vasconcelos

Nome da entidade responsável:

Morada: Edifício do Terminal Cruzeiros do Porto de Leixões, Av. General Norton de Matos s/n, 4450-208 Matosinhos, Portugal

Telefone: +351 223 401 800

Email: Enviar mail

Web: https://www.ciimar.up.pt

LinkedIn: https://www.linkedin.com/company/5173568/admin/

Facebook: https://www.facebook.com/ciimar.up.pt

Twitter: https://twitter.com/CiimarUp

Descrição da Instituição:
O CIIMAR é um centro de I&D da Universidade do Porto que tem como missão desenvolver investigação transdisciplinar e transnacional de excelência, promover o desenvolvimento tecnológico e a inovação e apoiar políticas públicas e governança na área das Ciências Marinhas e Ambientais. A estratégia de investigação e inovação do CIIMAR está assente num ambiente multidisciplinar organizado em linhas temáticas que permite abordar, de uma forma integrativa, importantes desafios científicos e societais.
Biotecnologia Marinha.

O CIIMAR desenvolve investigação de alto nível focada na exploração dos vastos recursos oceânicos para a descoberta e caracterização de novos compostos bioativos com aplicações ecológicas, farmacêuticas ou industriais. O estudo das toxinas emergentes, o desenvolvimento de biossensores para sistemas de deteção precoce e o desenvolvimento de ferramentas de biorremediação e fitorremediação para recuperação de ecossistemas são outros dos principais objetivos desta linha de investigação.
Alterações Globais e Serviços dos Ecossistemas

O CIIMAR fornece conhecimentos básicos e ferramentas para apoiar a proteção e gestão dos ecossistemas marinhos, estuarinos e de água doce, promovendo a exploração sustentável dos recursos oceânicos e produção de bens e serviços valiosos. O trabalho desenvolvido é realizado em estreita colaboração com as PME, as autoridades internacionais e locais e diversas entidades associadas a estes setores.
Biologia, Aquacultura e Qualidade dos Produtos Alimentares de Origem Aquática

O CIIMAR procura desenvolver novas espécies para aquacultura, produtos e métodos de cultura inovadores, que são essenciais para enfrentar os desafios societais da atualidade, relacionados com a nutrição humana e a qualidade dos produtos marinhos. O conhecimento científico inovador resultante da investigação básica e aplicada de alta qualidade é posteriormente transferido para utilizadores finais e para o sector industrial.

Áreas de especialização: Literacia, Formação e educação marítima, Monitorização estratégica da economia azul (Blue economy), Transferência de conhecimento e tecnologia, Biodiversidade e ecologia costeira, Poluição e impactos ambientais, Diagnóstico e resposta de ecossistemas costeiros a alterações climáticas, Avaliação jurídica e económica de ecossistemas costeiros e impactos ambientais, Modelação hidrodinâmica de sistemas costeiros e águas de transição, Atividade económica costeira: avaliação e sustentabilidade, Governança do ambiente marinho e costeiro, integração de políticas públicas terrestres e marinhas, responsabilidade social, Ordenamento do espaço marítimo: gestão de zonas costeiras, Reservas marinhas, Gestão integrada da zona costeira, recuperação e estruturas de proteção, Biomassa marinha/biofuel, Energia das ondas, Biodiversidade, Ciclos biogeoquímicos, Costa, hidrografia e dinâmica dos oceanos, Redes tróficas, Oceanografia biológica, Oceanografia física, Oceanografia química, Equipamentos e sensores, Redes de observação, Deteção remota, Alimentação e nutrição em aquacultura, Bem-estar animal, Biotecnologia aplicada à aquacultura, Ecologia marinha e culturas, Economia, legislação e gestão da Aquicultura, Afloramento de algas nocivas e biotoxinas marinhas, Genética e genómica aplicada à aquacultura, Patologia e imunologia, Economia, legislação e gestão de recursos marinhos, Avaliação de recursos da pesca, Avaliação do estado ecológico dos sistemas oceânicos, Avaliação do impacto da exploração de recursos, Investigação de recursos baseada no conhecimento dos ecossistemas, Tecnologias aplicadas a gestão de recursos, Mercados de produtos de origem marinha, redes comerciais e avaliação, Novos produtos de origem marinha, Obtenção, gestão e avaliação de subprodutos marinhos, Rastreabilidade, qualidade e segurança de alimentos de origem marinha

Palavras chave: Biorrecursos e Biotecnologia Azul; Aquacultura Sustentável e Segurança do Pescado; Conservação e Gestão Sustentável do Oceano; Economia circular e crescimento azul

Número de investigadores: 418

Número de doutorados: 190

Indicador SCOPUS: https://www.scopus.com/affil/profile.uri?afid=60013435

Repositório Científico de Acesso Aberto: https://repositorio-aberto.up.pt/handle/10216/119223

Projetos

Laboratório Transfronteiriço de Biotecnologia Marinha

Acrónimo: BlueBioLab

Programa de Financiamento: INTERREG VA Espanha-Portugal

Entidade financiadora: INTERREG VA Espanha-Portugal, FEDER

Ano de inicio: 2019

Ano de conclusão: 2021

Investigador Principal: Vitor Vasconcelos

URL: https://bluebiolab.eu/

Inovação industrial através de colaborações especificas entre empresas e centros de investigação no contexto de valorização biotecnológica marinha

Acrónimo: CVMAR+i

Programa de Financiamento: INTERREG VA Espanha-Portugal

Entidade financiadora: INTERREG VA Espanha-Portugal, FEDER

Ano de inicio: 2017

Ano de conclusão: 2020

Investigador Principal: Vitor Vasconcelos

URL: http://cvmari.cetmar.org/

Adaptação costeira às alterações climáticas: conhecer os riscos e aumentar a resiliência

Acrónimo: MarRISK

Programa de Financiamento: INTERREG VA Espanha-Portugal

Entidade financiadora: INTERREG VA Espanha-Portugal, FEDER

Ano de inicio: 2017

Ano de conclusão: 2020

Investigador Principal: Luisa Bastos / Ana Bio

URL: http://www.marnaraia.org/

Poluentes emergentes nas águas da Galiza-Norte de Portugal: novas ferramentas para gestão de risco

Acrónimo: NORWATER

Programa de Financiamento: INTERREG VA Espanha-Portugal

Entidade financiadora: INTERREG VA Espanha-Portugal, FEDER

Ano de inicio: 2019

Ano de conclusão: 2021

Investigador Principal: Miguel Santos

URL: http://nor-water.eu/

European Marine Biological Resource Centre Bank

Acrónimo: EBB

Programa de Financiamento: Interreg Espaço Atlântico

Entidade financiadora: Interreg Espaço Atlântico, FEDER

Ano de inicio: 2017

Ano de conclusão: 2020

Investigador Principal: Vitor Vasconcelos

URL: https://www.bluebiobank.eu/

Risk assessment and mitigation of the presence of engineered nanomaterials in Atlantic aquaculture

Acrónimo: NANOCULTURE

Programa de Financiamento: Interreg Espaço Atlântico

Entidade financiadora: Interreg Espaço Atlântico, FEDER

Ano de inicio: 2019

Ano de conclusão: 2022

Investigador Principal: Alexandre Campos

URL: https://spilless.ciimar.up.pt/

First line response to oil spills based on native microorganisms cooperation

Acrónimo: SpillLess

Programa de Financiamento: Blue Labs, EASME

Entidade financiadora: EASME, Comissão Europeia

Ano de inicio: 2017

Ano de conclusão: 2019

Investigador Principal: Ana Paula Mucha

URL: https://seafoodtomorrow.eu/

Nutritious, safe and sustainable seafood for consumers of tomorrow

Acrónimo: SEAFOODTOMORROW

Programa de Financiamento: Horizonte 2020

Entidade financiadora: Comissão Europeia

Ano de inicio: 2017

Ano de conclusão: 2020

Investigador Principal: Maria Leonor Nunes

URL: http://www.jpi-oceans.eu/

Climate change and future marine ecosystem services and biodiversity

Acrónimo: FutureMARES

Programa de Financiamento: Horizonte 2020

Entidade financiadora: Comissão Europeia

Ano de inicio: 2020

Ano de conclusão: 2024

Investigador Principal: Francisco Arenas

URL:

Ecotoxicological effects of microplastics in marine ecosystems

Acrónimo: EPHEMARE

Programa de Financiamento: JPI Oceans

Entidade financiadora: Fundação para a Ciência e a Tecnologia

Ano de inicio: 2016

Ano de conclusão: 2018

Investigador Principal: Lúcia Guilhermino

URL:

Publicações

Growth performance and nutrient utilisation of Senegalese sole fed vegetable oils in plant protein-rich diets from juvenile to market size

Autores: Pereira, R., Basto, A., Conde-Sieira, M., Linares, F., Rodríguez Villanueva, J.L., Sieira, G.P., Soengas, J.L., Valente, L.M.P.

Ano de publicação: 2019

Journal: Aquaculture, 511, 734229

DOI: http://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2019.734229

Physiopathological responses of sole (Solea senegalensis) subjected to bacterial infection and handling stress after probiotic treatment with autochthonous bacteria

Autores: Peixoto, M.J., Domingues, A., Batista, S., Gonçalves, J.F.M., Gomes, A.M., Cunha, S., Valente, L.M.P., Costas, B., Ozório, R.O.A.

Ano de publicação: 2018

Journal: Fish and Shellfish Immunology, 83, 348-358

DOI: http://doi.org/10.1016/j.fsi.2018.09.045

Norovirus contamination of sea urchins (Paracentrotus lividus): Potential food risk for consumers

Autores: Santos-Ferreira, N., Mesquita, J.R., Rivadulla, E., Inácio, Â.S., Nascimento, M.S.J., Romalde, J., Martins da Costa, P.

Ano de publicação: 2020

Journal: Food Control, 111, 107041

DOI: http://doi.org/10.1016/j.foodcont.2019.107041

Control of phosphate levels in seafood products from the Portuguese market: Is there a need for concern?

Autores: Teixeira, B., Vieira, H., Lourenço, H., Gonçalves, S., Martins, M.F., Mendes, R.

Ano de publicação: 2018

Journal: Journal of Food Composition and Analysis, 62, 94-102

DOI: http://doi.org/10.1016/j.jfca.2017.05.006

Temperature effects explain continental scale distribution of cyanobacterial toxins

Autores: Mantzouki, E., Lürling, M., Fastner, J., et al.

Ano de publicação: 2018

Journal: Toxins, 10 (4), 156

DOI: http://doi.org/10.3390/toxins10040156

Tetrodotoxins occurrence in non-traditional vectors of the north atlantic waters

Autores: Silva, M., Rodríguez, I., Barreiro, A., Kaufmann, M., Neto, A.I., Hassouani, M., Sabour, B., Alfonso, A., Botana, L.M., Vasconcelos, V.

Ano de publicação: 2019

Journal: Toxins, 11 (6), 306

DOI: http://doi.org/10.3390/toxins11060306

Toward a coordinated global observing system for seagrasses and marine macroalgae

Autores: Duffy, J.E., Benedetti-Cecchi, L., Trinanes, J. et al.

Ano de publicação: 2019

Journal: Frontiers in Marine Science, 6, 317

DOI: http://doi.org/10.3389/fmars.2019.00317

Chronic environmentally relevant levels of simvastatin disrupt embryonic development, biochemical and molecular responses in zebrafish (Danio rerio)

Autores: Barros, S., Montes, R., Quintana, J.B., Rodil, R., André, A., Capitão, A., Soares, J., Santos, M.M., Neuparth, T.

Ano de publicação: 2018

Journal: Aquatic Toxicology, 201, 47-57

DOI: http://doi.org/10.1016/j.aquatox.2018.05.014

The importance of marine observatories and of RAIA in particular(Review)

Autores: Bastos, L., Bio, A., Iglesias, I.

Ano de publicação: 2016

Journal: Frontiers in Marine Science, 3, 140

DOI: http://doi.org/10.3389/fmars.2016.00140

Performance assessment of the CECO wave energy converter: Water depth influence

Autores: Ramos, V., López, M., Taveira-Pinto, F., Rosa-Santos, P.

Ano de publicação: 2018

Journal: Renewable Energy, 117, 341-356

DOI: http://doi.org/10.1016/j.renene.2017.10.064

Patentes

Antimalarial agent, methods and uses thereof

Inventores: Pedro Leão (CIIMAR), Maria do Rosário Martins (CIIMAR/IPP), Margarida Costa (CIIMAR) e Vítor Vasconcelos (CIIMAR/FCUP); Fátima Nogueira (IHMT); Valentina Domingues (ISEP-IPP).

Referência: EP3313807; US 10,287,228

Ano de submissão: 2016

Instituições titulares: Universidade do Porto; CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental; Universidade Nova de Lisboa - Instituto de Higiene e Medicina Tropical; Instituto Politécnico do Porto.

Pyrazinoquinazolinone derivatives with antibacterial activity against Gram-positive bacteria

Inventores: Anake Kijjoa (CIIMAR/FCUP), Lucinda Bessa (CIIMAR), Paulo Martins da Costa (CIIMAR/ICBAS), Suradet Buttachon (CIIMAR/ICBAS), Tida Dethoup (Kasetsart University); Vitor Vasconcelos (CIIMAR/FCUP).

Referência: EP3313406

Ano de submissão: 2016

Instituições titulares: Universidade do Porto, CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental.

Autonomous aquaculture fish feeding system and operation method thereof

Inventores: Rodrigo Ozório (CIIMAR); Allan Souza (CIIMAR); Luís Pereira (CIIMAR); José Fernando Gonçalves (ICBAS); Miguel Fernandes (FoodInTech).

Referência: EP18723968.6

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, FoodInTech, Lda.

Method for obtaining proteins or a rich-protein extract from algae, extracts and uses therefore

Inventores: Luísa Valente (ICBAS/CIIMAR); Manuela Pintado (UCP); Sónia Batista (CIIMAR); Aurora Futuro Silva (FEUP); Jorge Faria (New Enzymes, Lda.).

Referência: WO2019171293A1; EP18215555.6

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental; Universidade do Porto, Universidade Católica Portuguesa - UCP, NEW ENZYMES, Lda.

Sporeforming probiotic strains, methods and uses thereof

Inventores: Claúdia Serra (CIIMAR); Paula Enes (CIIMAR); Aires Oliva Teles (FCUP); Fernando Tavares (FCUP).

Referência: EP18215588.7

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto.

Utilização de napiradiomicinas com actividade anti-incrustante e composições da mesma

Inventores: Susana Gaudêncio (FCT/UNL); Rita Almeida (FCT/UNL); Florbela Pereira (FCT/UNL); Ilda Barros Sanches (FCT/UNL); Susana Gonçalves (IPS); Isabel Cunha (CIIMAR); Joana Almeida (CIIMAR); Vitor Vasconcelos (CIIMAR) .

Referência: PT 115055

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade Nova de Lisboa, Instituto Politécnico de Setúbal.

Device for capturing in situ aquatic microbiomes

Inventores: Catarina Magalhães (CIIMAR); Alfredo Martins (INESC TEC/ISEP); Eduardo Silva (INESCTEC/ISEP); André Dias(INESC TEC/ISEP); Marco Gonçalves(INESC TEC); Mauricio Guedes (INESC TEC); Maria Paola Tomasino (CIIMAR); Nuno Dias (INESC TEC/ISEP); Sandra Ramos(CIIMAR); Ana Paula Mucha(CIIMAR); Fátima Carvalho(CIIMAR); Marisa Almeida(CIIMAR); Hugo Ribeiro (CIIMAR); José Almeida (ISEP).

Referência: EP18215568.9

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, INESC TEC - Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Tecnologia e Ciência, Instituto Superior de Engenharia do Porto.

Xanthonic Compounds and their use as antifouling agents

Inventores: Marta Correia da Silva (CIIMAR/FFUP); Madalena Pinto (CIIMAR/FFUP); Emilia Sousa (CIIMAR/FFUP); Vitor Vasconcelos (CIIMAR/FCUP); Joana Almeida (CIIMAR); Elisabete Geraldes (FCUL).

Referência: PT 115214

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Ultra-violet absorbing compounds

Inventores: Teresa Martins (CIIMAR); Pedro Leão (CIIMAR); Mariana Reis (CIIMAR); Vitor Vasconcelos (CIIMAR/FCUP); Vitor Ramos (CIIMAR); Meryem Hassouani (Chouaib Doukkali University); Brahim Sabour (Chouaib Doukkali University).

Referência: PT 115227

Ano de submissão: 2018

Instituições titulares: CIIMAR - Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, Chouaib Doukkali university.

Infraestrutura

O centro possui instalações bem equipadas para investigação, inovação, transferência de tecnologia, formação, educação e serviços. Inclui uma rede complementar de plataformas tecnológicas, disponibilizadas à comunidade nacional e internacional, destacando-se: acesso a ecossistemas; química analítica; aquacultura e experimentação animal; biodescoberta e biorrefinaria; bioinformática; coleções de culturas; ecotoxicologia; genómica e proteómica. Existe ainda uma plataforma específica para o desenvolvimento de négocios azuis, com o objetivo de promover a transferência de conhecimento entre o CIIMAR e o tecido empresarial, e promover colaborações que levam ao desenvolvimento de novas tecnologias, produtos e serviços.

O centro integra duas infraestruturas de investigação de relevância nacional e europeia: o Centro Europeu de Recursos Biológicos Marinhos (EMBRC-ERIC; https://www.embrc.eu/) e o Observatório Europeu Multidisciplinar do Fundo do Mar (EMSO-ERIC; http://emso.eu/), sendo um reconhecimento do CIIMAR como um centro de ciência e inovação.

Informações mais detalhadas sobre condições específicas (por exemplo, equipamentos e recursos específicos disponíveis) estão disponíveis em https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php ou podem ser fornecidas mediante solicitação.

Serviços

Acesso ao Ecossistema

Descrição:
Os ecossistemas costeiros nas proximidades do CIIMAR incluem uma grande diversidade de habitats marinhos e estuarinos. Extensas margens rochosas e praias de areia caracterizam a costa norte de Portugal. Também estão incluídas nesta área costeira zonas estuarinas, incluindo grandes desembocaduras, como no caso do rio Minho, Lima, Douro ou Cávado, e lagoas costeiras como a Ria de Aveiro. A plataforma de acesso ao ecossistema do CIIMAR visa facilitar as atividades de investigação, partilhando o seu vasto conhecimento sobre a fauna, flora e condições ambientais dos diferentes ecossistemas da costa norte portuguesa e fornecendo instalações e suporte logístico. As instalações de mergulho científico do CIIMAR estão totalmente equipadas para apoiar trabalhos de investigação subaquática, seguindo os padrões europeus de mergulho científico. O equipamento inclui equipamento completo para mergulho, ampla gama de ferramentas e instrumentos necessários para observação, experiências de manipulação, recolha de amostras biológicas e não biológicas e recolha de imagens (vídeo e fotografia). As instalações de investigação do CIIMAR incluem CTD multiparamétrico, sensores subaquáticos de luz e temperatura, dispositivos de amostragem de água e plâncton, hidrofone subaquático, recolha de sedimentos Van Veen, etc.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=1

Aquacultura e Experimentação Animal

Descrição:
A instalação de aquacultura e experimentação animal – Biotério de Animais Aquáticos (BOGA) é uma infraestrutura totalmente dedicada à experimentação e manutenção de uma ampla gama de organismos aquáticos (macro e microalgas, peixes, cefalópodes e outros invertebrados). A instalação é licenciada e inspecionada pela Autoridade Portuguesa para a proteção de animais utilizados em experimentação com fins científicos ou educacionais (DGAV - Direcção Geral de Alimentação e Veterinária). O BOGA oferece serviços de investigação sob contrato para estudos académicos e da industria relacionados com o impacto das condições ambientais (temperatura, fotoperíodo, pressão da água, qualidade da água, tóxicos) e uma ampla gama de produtos para a aquacultura (ingredientes para ração, aditivos), cumprindo os mais elevados pradrões de segurança e de bem-estar animal. O BOGA está organizado em áreas temáticas, multiuso e de suporte / técnicas. A instalação inclui sistemas de recirculação de aquacultura (RAS); sistemas para estudos de toxicologia e infecção com tratamentos específicos de efluentes; uma sala dedicada ao peixe-zebra capaz de fornecer linhas de peixes; câmaras hiperbáricas capazes de simular de 0 a 1000 metros de profundidade; e uma instalação de cultura de fitoplâncton.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=2

Biodiscoberta e Biorrefinaria

Descrição:
Com o objetivo geral de fornecer um acesso sustentável à diversidade química de nossos oceanos, o CIIMAR desenvolveu uma plataforma de biodiscoberta e biorrefinaria para passar do material biológico para compostos puros. O CIIMAR fornece instalações de processamento de biomassa e de biomassa em larga escala, bem como fotobiorreatores de última geração, uma coleção de extratos fracionados de microorganismos marinhos e uma crescente biblioteca de compostos puros. Podem também ser realizados no CIIMAR uma ampla gama de ensaios biológicos que podem auxiliar os esforços de biodescoberta, incluindo citotoxicidade em linha celular de cancro, ensaios antimicrobianos, antifúngicos, anti-obesidade e anti-inflamatórios, além de bioensaios ecologicamente relevantes para testar atividades de microfouling, anti-macrofouling e anti-algal. Além disso, a Plataforma de Biodescoberta e Biorrefinaria do CIIMAR tem a capacidade de realizar o isolamento de produtos naturais na escala de mg, caracterização estrutural (usando HRMS e RMN) e iterações de produtos químicos.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=7

Coleção de Culturas

Descrição:
A Blue Biotechnology and Ecotoxicology Culture Collection (LEGE-CC) é uma coleção de microorganimos que compreende mais de 386 estirpe diferentes de cianobactérias, várias delas únicas entre a diversidade (filogenética) do grupo. Estes isolados foram obtidos desde 1991, a partir de amostras colhidas em diferentes ambientes e localizações principalmente em Portugal (incluindo as Ilhas da Madeira e Açores), mas também em outros lugares (por exemplo, Austrália, Brasil, Colômbia, Marrocos, México). A coleção é um membro recente da World Federation for Culture Collections (WFCC) e também faz parte da infraestrutura de investigação EMBRC.PT. O LEGE-CC procura fornecer culturas iniciais para uma ampla gama de objetivos (investigação e desenvolvimento, educação e disseminação). Vários estudos demonstraram o potencial ou a capacidade efetiva de diferentes estirpes de LEGE para produzir uma infinidade de compostos químicos, incluindo toxinas ou moléculas bioativas com potencial aplicação biotecnológica. A coleção inclui ainda outro tipos de bactérias, como planctomicetes e actinomicetes.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=3

Genómica e Proteómica

Descrição:
Genómica é o estudo dos genomas dos organismos. O seu principal objetivo é determinar a sequência parcial ou completa do DNA por meio de uma amplificação de um único gene através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) ou através de sequenciação de genes em larga escala pelo Sequenciação de Nova Geração (NGS). Como o produto final de um gene geralmente é uma proteína, o conhecimento da sequência de DNA se tornou de vital importância na medicina e na biotecnologia, revelando as bases de algumas doenças por meio de mutações específicas. Além disso, a genómica evolutiva que combina trabalho experimental e ferramentas bioinformáticas é atualmente uma parte importante da investigação biológica no campo da genómica, permitindo a reconstrução filogenética das famílias de genes, com informações sobre a história natural da vida. A proteómica, juntamente com a genómica, é hoje em dia uma ferramenta de investigação indispensável nas ciências biológicas e ambientais. A evolução da tecnologia, nomeadamente ao nível da espectrometria de massa, permite hoje em dia o acesso a informações quantitativas de centenas de proteínas, que tem sido utilizado para interpretar respostas metabólicas e fisiológicas relevantes em organismos, que os métodos bioquímicos convencionais não podem fornecer. O CIIMAR utiliza várias estratégias proteómicas no campo da toxicologia, nomeadamente para entender e caracterizar o modo de ação de contaminantes ambientais em organismos aquáticos. Além disso, a proteómica tem sido usada para identificar e caracterizar propriedades metabólicas e fisiológicas únicas dos invertebrados marinhos. Concretamente, o CIIMAR possui experiência e fornece à comunidade científica as seguintes análises proteómicas: SDS-PAGE; -DE; Blue-native PAGE; label-free quantitative proteomics; shotgun proteomics. Até a presente data, o aumento contínuo de sequências de organismos não-modelo em bancos de dados públicos (genomas, transcriptomas e proteomas inteiros) impulsionou estudos proteogenômicos detalhados, descrevendo milhares de novos genes e proteínas, com insights sobre processos complexos em diversas vias metabólicas.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=4

Química Analítica

Descrição:
O CIIMAR possui laboratórios analíticos bem equipados, com diferentes equipamentos analíticos, incluindo analisadores de fluxo segmentado (SFA), espectrómetros de absorção atômica (AAS), espectrómetros de massa para cromatografia líquida (LC-MS / MS) e HPLC, cromatografia em fase gasosa com diferentes detectores (Detector por Ionização de Chama -GC-FID e espectrometria de massa), s e analisadores de elementos orgânicos - espectrómetro de massa de razões isotópica (EA-IRMS), que permite a quantificação de uma vasta gama de compostos em diferentes matrizes com diversas finalidades. Esses equipamentos são utilizados pelos investigadores do CIIMAR, permitindo, por exemplo, a quantificação de poluentes em diferentes compartimentos do ecossistema, o estabelecimento de parâmetros de toxicidade, a avaliação das medidas de recuperação de ecossistemas por meio de ferramentas biotecnológicas, a identificação de compostos bioativos ou avaliação do estado nutricional de alimentos de origiem marinha, combinando dados químicos e biológicos numa abordagem multidisciplinar.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=8

Substâncias Perigosas e Nocivas (HNS)

Descrição:
Substâncias Perigosas e Nocivas (HNS) podem ser definidas como qualquer outra substância que não seja o petróleo que possa induzir danos aos recursos vivos e à saúde humana ou que tenha um impacto prejudicial ao meio ambiente se introduzida no mar. A gravidade do impacto de um derrame depende de várias variáveis, como localização, condições climáticas, propriedades das substâncias perigosas transportadas, forma de embalagem e armazenamento das substâncias e operações de resposta. Ao contrário dos derrames de óleo, há menos informação disponível para estabelecer critérios de risco e protocolos de avaliação para derrames de HNS devido à grande variedade de propriedades físicas, químicas e toxicológicas da HNS. Esta plataforma online de HNS fornece informações sistematizadas das propriedades dos HNS, incidentes e respostas anteriores a derrames, ferramentas educacionais, diretrizes e protocolos, um índice ambiental de sensibilidade para a costa portuguesa e ferramentas de modelação. Esta plataforma visa apoiar a preparação e a resposta a derrames acidentais (incluindo petróleo), a fim de promover um processo de tomada de decisão mais eficaz.

Nome do serviço: Tecnologias/Plataformas Tecnológicas

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=11

Plataforma de Negócios Azuis

Descrição:
A plataforma de desenvolvimento de negócios azuis tem a missão de promover a transferência de conhecimento entre o CIIMAR e o tecido empresarial, e promover colaborações que levam ao desenvolvimento de novas tecnologias, produtos e serviços. A plataforma de desenvolvimento de negócios azuis visa ser um facilitador nos seguintes processos: - procura de soluções inovadoras para as necessidades do mercado, por meio de consultoria ou colaboração - construção de parcerias, disponibilizando a nossa experiência e instalações para apoiar as necessidades de investigação - promoção do empreendedorismo e criação de empresas start-up Integrada no Gabinete de Ciência e Inovação do CIIMAR, a plataforma de desenvolvimento de negócios azuis apoia a criação de valor baseada no conhecimento, contribuindo para a competitividade e sustentabilidade da economia azul. Nesta perspetiva de promoção da economia azul em Portugal, o CIIMAR criou, em colaboração com a Bluebio Alliance, o Roteiro da Bioeconomia Azul para Portugal, que agrega: o mapeamento da Bioeconomia Azul em Portugal (principais bio-recursos azuis e principais campos de aplicação); a definição dos desafios da bioeconomia azul portuguesa; dar uma visão global das acçõese roteiro da bioeconomia azul em Portugal até 2030 (https://www2.ciimar.up.pt/pdfs/resources/roadmap_digital_hGBit_.pdf).

Nome do serviço: Consultoria

URL: https://www2.ciimar.up.pt/platforms.php?id=9

Curso de Ciências de Animais Aquáticos de Laboratório (CAL-AQUA)

Descrição:
A utilização de animais para fins científicos encontra-se regulamentada em Portugal pela Direção Geral de Alimentação e Veterinária (DGAV), única autoridade competente responsável pela implementação da legislação. Requer que os estabelecimentos onde os animais são alojados, as pessoas que os utilizam, bem como os projetos em que os mesmos sejam envolvidos estejam previamente autorizados pela DGAV e cumpram a legislação relativa à “proteção dos animais utilizados para fins científicos”. De acordo com o artigo 31.º, ponto 2, do Decreto-Lei n.º 113/2013, as funções referidas no parágrafo anterior são as seguintes: a) Realização de procedimentos em animais; b) Conceção de procedimentos e projetos; c) Prestação de cuidados aos animais. A certificação para a utilização de animais para fins científicos encontra-se igualmente regulamentada pela DGAV. Esta entidade é a autoridade responsável pela implementação da legislação, neste sentido também é o órgão responsável pela emissão da certificação, seja de pessoas, instituições e/ou projetos. O curso CAL-AQUA (Curso de Ciências de Animais Aquáticos de Laboratório) tem uma duração de 42 horas (21.5h teóricas + 20.5h práticas) lecionadas em 5 dias consecutivos, sendo um requerimento legal para todos aqueles que pretendem fazer experimentação animal ou trabalhar com animais de laboratório, mais especificamente com organismos aquáticos (peixes e anfíbios). O curso CAL-AQUA tem como objetivo fornecer competências a quem pretende trabalhar com modelos animais aquáticos experimentais e precisem ser creditados como investigadores pela DGAV. O curso CAL-AQUA visa especificamente a utilização de organismos aquáticos como modelos experimentais, com particular incidência nos vertebrados. O programa deste curso está de acordo com os critérios estabelecidos pela DGAV e pela Federation of European Laboratory Animal Science (FELASA) para cursos de Ciências em Animais de Laboratório, para educação e treino de pessoas que trabalham com animais laboratoriais e realizam as funções descritas no Artigo 31 do Decreto-Lei 113/2013, alinhas a), c) e d) (anteriormente conhecido por “Categoria FELASA B”). A frequência com aproveitamento deste curso permitirá obter certificação como “Investigador” ou “Técnico de Investigação” para a realização de experimentação animal (antigas categorias C ou B, em função da avaliação curricular por parte da DGAV).

Nome do serviço: Formação/Educação

URL: https://www2.ciimar.up.pt/education.php#courses_2

Blue Young Talent (BYT)

Descrição:
Um programa pré (BYT) e pós-graduado (BYT+, BYTPhD) de captação de talentos nas áreas interdisciplinares de investigação do CIIMAR como sejam as biotecnologias marinhas, alterações globais, serviços dos ecossistemas, conservação, aquacultura e nutrição. Os programas BYT, BYTplus e BYTPhD tem como objetivo proporcionar aos melhores alunos do primeiro segundo e terceiro ciclo uma formação ambiente científico estimulante e de excelência, em parceria com a indústria e PMEs. Aos candidatos BYT, BYT+ e BYTPhD selecionados ser-lhes-á atribuída um bolsa de e a oportunidade de realizar o seu projeto de estágio ou a sua dissertação de mestrado ou doutoramento junto de equipas de investigação do CIIMAR, bem como na participação num conjunto de atividades de enriquecimento pré e pós graduado que potencie a excelência científica bem como o empreendedorismo na área do mar e a sua inserção no mercado de trabalho.

Nome do serviço: Formação/Educação

URL: http://byt.ciimar.up.pt/