Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos

Tipo: Organizaciones públicas de investigación (OPI)

Acrónimo: CIBIO

Nombre del coordinador: Nuno Ferrand de Almeida

Nombre de la institución a la que pertenece: ICETA, UP

Dirección: Campus de Vairão, Rua Padre Armando Quintas nº 7, 4485-661 Vairão, Portugal

Teléfono: +351 252 660 400

E-mail: Enviar mail

Web: https://cibio.up.pt/

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Facebook: https://www.facebook.com/cibio.inbio/

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Descripción:
The mission of CIBIO is to develop world-class research in the areas of biodiversity and evolutionary biology.

CIBIO has 3 main thematic lines, which are (i) Evolution, Genetics & Genomics; (ii) Biodiversity, Ecology & Conservation; and (iii) Sustainability, Ecosystems & the Environment.

The main activity areas are:
- Advancing scientific knowledge in the fields of biodiversity and evolutionary biology - special emphasis on the understanding of processes that lead to present-day patterns of biological diversity and on the principles governing the spatial partitioning of genotypic and phenotypic variation.
- Integrating and deepening ecological, taxonomical and biogeographical knowledge at different scales worldwide - with a particular focus on the Iberian and Mediterranean biological heritage.
- Using scientific knowledge to set and suggest appropriate conservation priorities and management tools - in collaboration with local and national agricultural, forestry and hunting authorities.
- Providing top-level advanced training - MSc and PhD levels and short-term training courses.
- Disseminating scientific knowledge and promoting public awareness and appreciation of biodiversity.

Áreas de especialización: Incubación de Empresas, Transferencia de conocimiento y tecnología, Biodiversidad y ecología litoral, Diagnóstico y respuesta de los ecosistemas costeros frente al cambio climático, Biodiversidad, Costa, hidrografia y dinámica de los océanos, Recursos explotables, Oceanografía biológica, Oceanografía física, Equipamientos y sensores, Redes de observación, Genética y genómica aplicada a la acuicultura, Patología e inmunología de organismos en cultivo, Evaluación de recursos pesqueros y marisqueros, Evaluación del estado ecológico de los sistemas oceánicos, Investigación de los recursos basada en el conocimiento de los ecosistemas

Palabras clave: Biodiversity, Genetics, Conservation, Climate, Evolution, Environment

Número investigadores: 400

Número doctores: 180

Identificador Scopus:

Repositorio científico de acceso abierto:

Proyectos

The buffering effects of upwelling and geomorphology on coastal warming

Acrónimo: ThermalBuffer

Programa de financiación:

Entidad financiadora: COMPETE e FCT

Año de inicio: 2018

Año de finalización: 2021

Investigador principal: Fernando P. Lima

URL del proyecto:

Fine scale mapping, modelling and quantification of thermal habitat in rocky shore ecosystems in Northern Portugal

Acrónimo: NORTE_ROCKS

Programa de financiación:

Entidad financiadora: COMPETE e FCT

Año de inicio: 2018

Año de finalización: 2021

Investigador principal: Rui Seabra

URL del proyecto:

Developing a 'daily-diary' tag to infer predator-prey interactions under environmental gradients

Acrónimo: SharkTag

Programa de financiación:

Entidad financiadora: COMPETE e FCT

Año de inicio: 2018

Año de finalización: 2021

Investigador principal: Nuno Queiroz

URL del proyecto:

Modelling the water and fish microbiomes to monitor and predict pathogen outbreaks

Acrónimo: MicrobeModel

Programa de financiación:

Entidad financiadora: COMPETE e FCT

Año de inicio: 2018

Año de finalización: 2021

Investigador principal: Raquel Xavier

URL del proyecto:

Assessment of the distribution and ecological status of Sabellaria alveolata reefs in Europe

Acrónimo: REEHAB

Programa de financiación:

Entidad financiadora: TOTLA Foundation

Año de inicio: 2015

Año de finalización: 2019

Investigador principal: Stanislas Dubois (Ifremer)

URL del proyecto:

Desenvolvimento de ferramentas moleculares para o melhoramento do conhecimento e da gestão dos stocks de Sardinha

Acrónimo: SARDINOMICS

Programa de financiación:

Entidad financiadora: Mar2020

Año de inicio: 2019

Año de finalización: 2021

Investigador principal: António Múrias Santos

URL del proyecto:

Integrated Platform for Marine Data Acquisition and Analysis

Acrónimo: MARINFO

Programa de financiación:

Entidad financiadora: Norte2020

Año de inicio: 2016

Año de finalización: 2018

Investigador principal: António Múrias Santos

URL del proyecto:

Applying elasmobranch immunogenetics to fisheries management and the study of vertebrate adaptive immunity

Acrónimo: E-Imuno

Programa de financiación:

Entidad financiadora: COMPETE e FCT

Año de inicio: 2018

Año de finalización: 2021

Investigador principal: Ana Veríssimo

URL del proyecto:

Publicaciones

Global spatial risk assessment of sharks under the footprint of fisheries

Autores: Queiroz, N., Humphries, N. E., Couto, A., Vedor, M., Da Costa, I., Sequeira, A. M., ... & Abrantes, K.

Año de publicación: 2019

Journal: Nature

DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-019-1444-4

Biologists ignore ocean weather at their peril

Autores: Amanda E. Bates, Brian Helmuth, Michael T. Burrows, Murray I. Duncan, Joaquim Garrabou, Tamar Guy-Haim, Fernando P. Lima, Ana M. Queiros, Rui Seabra, Robert Marsh, Jonathan Belmaker, Nathaniel Bensoussan, Yunwei Dong, Antonios D. Mazaris, Dan Smale, Martin Wahl and Gil Rilov

Año de publicación: 2018

Journal: Nature

DOI: http://doi.org/

Remotely-sensed L4 SST underestimates the thermal fingerprint of coastal upwelling

Autores: Claudia Meneghesso, Rui Seabra, David S. Wethey, Bernardo R. Broitman, Benny K. K. Chan, Gil Rilov, Pedro A. Ribeiro, Lara L. Sousa, Michael T. Burrows and Fernando P. Lima

Año de publicación: 2020

Journal: Remote Sensing of Environment

DOI: http://doi.org/

Reduced nearshore warming associated with Eastern Boundary Upwelling Systems

Autores: Rui Seabra, António M. Santos, Rubén Varela, Moncho Gomez-Gesteira, Cláudia Meneghesso*, David S. Wethey and Fernando P. Lima

Año de publicación: 2019

Journal: Frontiers in Marine Science

DOI: http://doi.org/

Loss of thermal refugia near equatorial range limits

Autores: Fernando P. Lima, Filipa Gomes, Rui Seabra, David S. Wethey, Inês Seabra, Teresa Cruz, António M. Santos and Thomas J. Hilbish

Año de publicación: 2016

Journal: Global Change Biology

DOI: http://doi.org/

cean-wide tracking of pelagic shark interactions with longline fishing vessels reveals persistent exploitation hotspots

Autores: Nuno Queiroz, Nicolas E. Humphries, Gonzalo Mucientes, Neil Hammerschlag, Fernando P. Lima, Kylie Scales, Peter Miller, Lara L. Sousa, Rui Seabra and David W. Sims

Año de publicación: 2016

Journal: PNAS

DOI: http://doi.org/

Convergence of marine megafauna movement patterns in coastal and open oceans

Autores: Ana MM Sequeira, JP Rodríguez, Víctor M Eguíluz, R Harcourt, M Hindell, David W Sims, Carlos M Duarte, Daniel P Costa, Juan Fernández-Gracia, LC Ferreira, Graeme C Hays, Michelle R Heupel, Mark G Meekan, A Aven, Fred Bailleul, AMM Baylis, Michael L Berumen, Camrin D Braun, Jennifer Burns, M Julian Caley, Richard Campbell, Ruth H Carmichael, Eric Clua, LD Einoder, Ari Friedlaender, Mike E Goebel, Simon D Goldsworthy, Christophe Guinet, John Gunn, Derek Hamer, Neil Hammerschlag, M Hammill, LA Hückstädt, Nicolas E Humphries, M-A Lea, Andrew Lowther, Alice Mackay, Elizabeth McHuron, Jane McKenzie, Lachlan McLeay, Clive R McMahon, K Mengersen, MMC Muelbert, Anthony M Pagano, Bradley Page, Nuno Queiróz, Patrick W Robinson, Scott A Shaffer, M Shivji, Gregory B Skomal, Simon R Thorrold, Stella Villegas-Amtmann, Michael Weise, R Wells, B Wetherbee, Annalise Wiebkin, Barbara Wienecke, Michael Thums

Año de publicación: 2018

Journal: PNAS

DOI: http://doi.org/

Analysis of bacterial microbiome associated with nylon and copper nets in an aquaculture context

Autores: Canada, Paula, Ana Pereira, Natacha Nogueira, Lydia Png-Gonzalez, Carlos Andrade, and Raquel Xavier

Año de publicación: 2020

Journal: Aquaculture

DOI: http://doi.org/

A haplotype-resolved draft genome of the European sardine (Sardina pilchardus)

Autores: Louro, Bruno, Gianluca De Moro, Carlos Garcia, Cymon J. Cox, Ana Veríssimo, Stephen J. Sabatino, António M. Santos, and Adelino VM Canário.

Año de publicación: 2019

Journal: GigaScience

DOI: http://doi.org/

Phylogenetic evidence for an ancestral coevolution between a major clade of coccidian parasites and elasmobranch hosts

Autores: Raquel Xavier, Joana L Santos, Ana Veríssimo

Año de publicación: 2018

Journal: Systematic Parasitology

DOI: http://doi.org/

Infraestructura

CIBIO has modern and well-equipped ecology and molecular biology laboratories, modern offices, experimental fields and greenhouses, animal facilities for invertebrate and vertebrate species, as well as for marine and freshwater species.

CIBIO-InBIO was the first Portuguese Research Centre, considering all scientific fields, to win a 3.5M€ EU CAPACITIES Program, used to install a Next-Generation DNA Sequencing Platform, specifically through the acquisition of the equipment Illumina HiSeq 1500, Illumina MiSeq and IlluminaCompute system (Dell/Isilon). Later, the capacity of CIBIO-InBIO to develop research and innovation was also boosted by an ERA Chair EnvMetaGen funded by H2020.
The molecular genetics and ecology laboratories form a very strong experimental and analytical component and possess a dedicated Centre for Molecular Analyses.

CIBIO also has an electronics laboratory equipped with PCB prototyping, 3D scanning and printing, thermoforming and potting capabilities, and a high-performing multicore server.

Servicios

Technology transfer startup

Descripción del servicio:
Startup developing tools for environmental monitoring and biologging

Tipo de servicio: Tecnologías/Plataformas Tecnológicas

URL servicio: http://www.electricblue.eu